911

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

Пикотехнология белков, ДНК, РНК

Попробуем создать PDB-файл спирали коллагена

http://img-fotki.yandex.ru/get/4401/126580004.40/0_b1f8f_a22cc5e2_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/4702/126580004.40/0_b1f90_254ccef4_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/5503/126580004.40/0_b1f8e_f9a84c6c_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/4606/126580004.40/0_b1f98_49c432f5_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/5504/126580004.40/0_b1f96_ad0be77d_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/4511/126580004.40/0_b1f95_3744ca9c_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/4700/126580004.40/0_b1f97_a4b7e958_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/4703/126580004.40/0_b1f92_d40eaf9c_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/4606/126580004.40/0_b1f93_e67ee122_L.gif

http://img-fotki.yandex.ru/get/4700/126580004.40/0_b1f91_7340f420_L.gif

http://img-fotki.yandex.ru/get/4700/126580004.40/0_b1f94_85ac777a_L.gif

Две цепи спирали в первом приближении получились. Однако вручную дублировать координаты атомов неудобно. Попробуем модифицировать скрипт Савина-Кушелева, чтобы он мог автоматически создавать PDB-файлы с любым числом субъединиц.

912

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

LOS пишет:
Kushelev пишет:

Кушелев: Вы не путаете понятие модель с понятием расчёт?

У Вас мат модель, описываемая некой системой уравнений. Расчёт этой системы уравнений даёт результат в виде числового представления.
Вы продаёте, собираетесь продавать эти числа. Люди подразумевают что Ваши данные получены в ходе прямого измерения (микроскопом сфотографировали и посчитали пиксели). Поэтому у них возникает к Вам вопрос: "а какая там точность после запятой?". Неправильно им отвечать "точность пико". Нужно сказать что данные получены в ходе математического моделирования.

Только не математического моделирования, а физического модельного эксперимента. Упрощённого, конечно, но всё же эксперимента.

913

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

LOS пишет:

У Вас я так понимаю вообще все формулы представлены геометрическими преобразованиями с единственной присутствующей константой, задающей точность (расчёта!), - числом Пи.

Нет. Там ещё присутствует радиус кольцевого электрона, композиционные углы, которые взяты из натурных и модельных экспериментов.

Точность модели можно оценить с помощью набора экспериментальных данных. Я Вам уже написал, что в первом приближении точность определяется толщиной электрона. Можно и точнее, но чуть позже smile

914

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

LOS пишет:

PS. пико - это размеры моделируемых объектов, не более. А реальная точность расчётов у Вас (по тем листингам что Вы показываете) всего лишь три знака после запятой (10-3).

Точность расчётов можно сделать хоть двойной. Речь идёт о реальной погрешности, а она определяется в первом приближении толщиной электрона (малым диаметром тора):

http://img-fotki.yandex.ru/get/5600/126580004.40/0_b1ec9_623b0fe3_L.png

http://img-fotki.yandex.ru/get/2714/126580004.40/0_b1eca_90b20ae9_L.jpg
При переходе от методики НАНО к методике ПИКО погрешность модели уменьшается от большого диаметра тора до малого.

http://img-fotki.yandex.ru/get/4401/126580004.40/0_b1ed2_ef712583_L.gif
Нано-методика не позволяет заметить деталей, размер которых меньше атома. Пико-методика позволяет заметить детали, размер которых в ~1000 раз меньше, а при учёте большого числа факторов, погрешность пико-методики можно сделать сколь угодно малой, т.к. в классической физике в отличие от квантовой "механики" нет места неопределённости.

915

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

Анатолий Шестопалов пишет:

Александр Юрьевич, это у кого-то в голове или этот бред в природе существует?
Где этот (электрон-позитрон)*n+(электрон/позитрон) в Таблице Менделеева?
Какие у вас доказательства или хотябы предпосылки, чтобы я задумался?

Кушелев: Вообще-то в таблице Менделеева размещены химические элементы. Ионов там нет. Тем не менее ионы H+,H- существуют. Существует и молекулярный ион H2+: http://ru.wikipedia.org/wiki/%CC%EE%EB% … 0%EE%E4%E0
Там же написано и про молекулярный ион H3+, хотя картинка в википедии неправильная.
Ион e-p-e (электрон-протон-электрон) может существовать в вакууме. В растворе он, если мне не изменяет память, неустойчив.

916

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

Анатолий Шестопалов пишет:

С какого перепуга свободному электрону прилипать к нейтрально заряженному атому?

Электрон N2 притягивается к протону атома и оттесняет электрон N1. В свободном пространстве к одному протону потянутся все электроны. Однако если электронов больше двух, то третий электрон будет отталкиваться от них уже сильнее, чем притягиваться к единственному протону. Если же электронов только два, то они расположатся с разных сторон от протона и расстояние между ними будет больше, чем до протона. Система получается устойчивой. Но это в вакууме. Если же бросить такой ион в раствор, то ион e-p-e диссоциирует на нейтральный атом водорода и электрон. В свою очередь электрон объединится с какой-нибудь молекулой, и атом водорода тоже сравнительно быстро провзаимодействует с какой-нибудь молекулой.

917

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

LOS пишет:

Документальные съемки НЛО с борта косм.аппаратов NASA
http://www.youtube.com/watch?v=s9T7r6bVpg0

Очеееень быстро летают. Наворуют редкоземельных элементов и смоются. smile

Мало ли что там пролетело. В августе-сентябре на ночное небо посмотрите. Ещё больше заметите "падающих звёзд" smile

918

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

LOS пишет:
Kushelev пишет:

У меня во-первых, не только математическая модель. Я рассматриваю физику процесса, который представляет собой электрон.

Всё что я говорил, касалось только касательно 3D.

А смысл сказанного Вами? Мы же точность модели обсуждаем, а не точность калькуляторов smile

919

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

Kushelev пишет:

Вообще-то в таблице Менделеева размещены химические элементы. Ионов там нет. Тем не менее ионы H+,H- существуют.

Кроме вашего "существуют" вы не смогли привести ни одного аргумента более.

О положительно заряженных ионах я не спрашивал так они существуют вне всякого сомнения - "ободрали" химический элемент, любой из Таблицы менделеева и получили положительно заряженный ион. Так как ионы получают из химических элементов, то таблица Менделеева это одновременно и таблица ионов химических элементов.

Kushelev пишет:

Электрон N2 притягивается к протону атома и оттесняет электрон N1.

Ну если предположить, что электроны имеют разные заряды ..., тогда конечно есть вероятность что N1 окажется слабаком и уступит свое место электрону N2.

920

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 33

Анатолий Шестопалов пишет:

если предположить, что электроны имеют разные заряды ..., тогда конечно есть вероятность что N1 окажется слабаком и уступит свое место электрону N2.

Дело не в разных зарядах, а в том, что ближний к ядру электрон находится в потенциальной яме, и его можно отодвинуть легко. В результате электроны оказываются на склоне потенциальной ямы по разные стороны от протона.

На них действуют силы отталкивания, которые меньше сил притяжения к ядру, т.к. оно ближе к электронам, чем электроны друг к другу.

Электроны начинают сближаться, пока не упрутся друг в друга силами Гука (упругости). Равновестная система и есть ион водорода H-

"Два кольца, а посередине гвоздик" smile