20010502 Программирование структур (Scripts for 3D-Studio)

Начнем с создания модели атома. Сначала кольца-электроны пересекают друг друга, что не соответствует действительности, но такие конструкции могут быть применены в строительстве и конструировании другой техники.

Текст программы

Виртуальная модель

Текст программы

Текст программы

 

Текст программы

Виртуальная модель

Текст программы

Виртуальная модель

Наконец, получена модель кольцегранного атома, в которой кольца-электроны лишь касаются друг друга.

Модель молекулы воды. (Стереопару см. в технологическом архиве)

Текст программы

Виртуальная модель

Желтыми шариками обозначены атомные ядра. В центре молекулы воды расположено ядро кислорода. Более мелкие шарики обозначают протоны, т.е. ядра атомов водорода

 

Текст программы создания структуры аминокислоты

Модель аминокислотного остатка глицина. Эта модель поможет нам построить структуры белков с точностью до толщины кольца-электрона, т.е. до пикометра.

Предыдущая версия программы "Пикотехнология" изображает эту структуру аминокислотного остатка упрощенно, т.е. вычисляет координаты центров атомов в стандарте PDB (Protein Data Base - База белковых структур). Переходя от координат атомов к кольцегранной модели молекулы-сустава мы увеличиваем точность моделирования в 1000 раз. От нанотехнологии мы переходим к пикотехнологии.

Текст демонстрирующий возможности скриптов для 3D-Studio Max

Для построения структуры белка, состоящего из моделей аминокислот (каждая модель аминокислоты состоит из 24 колец-электронов) необходимо дописать созданный нами скрипт. Это можно сделать, усовершенствовав программу CASP3. Эта программа рассчитывает углы под которыми нужно расположить элементы белка (минокислоты).

Доработанная программа CASP3 должна записать в файл созданный нами сегодня скрипт, по которому строится аминокислота, затем сгенерировать и дописать скрипт, пристраивающий копию следующей аминокислоты к предыдущей, согласно рассчитанным по генетическому коду углам.

Текст программы создания структуры аминокислоты в виде одного объекта

В результате самосборки объединились 5 аминокислот

Текст программы создания субъединиц белка для самосборки

Белок, полученный в результате самосборки субъедини, состоящих из 5 аминокислот

Анимацию можно посмотреть на диске-приложении технологического архива data0707/avi/68.avi (MPEG-4)

Текст программы собравшегося самосборкой белка

Текст программы построения белка рибосомой по генетическому коду (Pascal)

Тексты программ построения кольцегранных моделей в стандарте Китеж (1994 год)

Магический кристалл, над которым задумались большой и маленький ангелы.

В этом кристалле выполняется условие сдвига фаз двух ярусов стоячей электромагнитной волны, существующей в кристалле за счет полного внутреннего отражения от поверхности граней. Это форма микроволнового источника энергии в стиле ренессанс

Текст программы создания этого восьмигранника

Виртуальная модель

Продолжение

http://ftp.decsy.ru/nanoworld/index.htm